Biofizycy z University of Tennessee wykorzystali zbudowany przez IBM superkomputer SUMMIT do walki z epidemią CoV-19. SUMMiT ma za zadanie znaleźć odpowiedni lek przeciwko koronawirusowi, odpowiedzialnemu za obecną pandemię.

Po kilku dniach obliczeń superkomputerowi udało się znaleźć co najmniej 77 związków, które potencjalnie mogłyby uchronić ludzkie komórki przed wirusem. Odkrycie to zostało opublikowane w artykule dostępnym na serwerze preprint ChemRxiv. Artykuł oczekuje na recenzję, co oznacza, że badania wciąż są w toku.

Powierzchnie koronawirusów pokryte są kolczastymi białkami podobnymi do korony (stąd nazwa), które umożliwiają wirusom wiązanie się i infekowanie ludzkich komórek. Dzięki zrozumieniu białek wirusów i receptorów ludzkich komórek gospodarza, a także sposobu interakcji z nimi innych związków chemicznych, możliwe jest ustalenie skuteczności leków przeciwko patogenowi.

SUMMIT wykorzystano do dogłębnej analizy bazy danych ponad 8 tys. związków znanych z istniejących leków, chemikaliów, leków ziołowych i produktów naturalnych. Jego zadaniem było wykrycie związków, które mogą wiązać się z białkiem koronawirusa, blokując go przed zainfekowaniem organizmu.

„Badanie zajęło nam dzień lub dwa, podczas gdy zajęłoby to miesiące na normalnym komputerze” – powiedział autor badania, Jeremy Smith, dyrektor Centrum Biofizyki Molekularnej Uniwersytetu w Tennessee.

Oczywiście nie ma gwarancji, że jakiekolwiek związki znalezione przez superkomputer będą skuteczne w praktyce. Ponadto, podobnie jak każdy lek, będzie wymagał obszernych testów i badań klinicznych, zanim stanie się dostępny dla pacjentów. Jednak praca superkomputera pomogła zidentyfikować obiecujących kandydatów do podjęcia dalszych badań.

Badania te nie są pierwszymi, które używają superkomputerów do znajdowania nowych leków. W zeszłym miesiącu naukowcy wykorzystali nowatorski algorytm komputerowy do przeszukania ogromnego cyfrowego archiwum ponad 100 milionów związków chemicznych.